Идеальный прибор для рутинных исследований в таких областях как фармакопейный и клинический анализ, определение примесей в спиртосодержащей продукции,  определение жирнокислотного состава, судебно-медицинская экспертиза, нефтеперерабатывающая промышленность и т.п. Прибор компактен ( ½ от пространства, необходимого для установки обычного лабораторного газового хроматографа) и не дорог.
Прибор представляет собой одноканальный газовый хроматограф с инжекторами 1177 (капиллярный с возможностью деления потока) и 1041 (насадочные колонки и капиллярные колонки 0.53 мм.) и детекторами ПИД и катарометр (с возможностью поддува газа для работы в режиме малых потоков). Прибор снабжен полным (инжектор и детектор) электронным контролем газовых потоков. Хроматограф выпускается со встроенной панелью управления и опцией контроля параметров с внешней компьютерной станции управления и обработки данных. Хроматограф 3900 имеет встроенный аналоговый выход детектора для подключения к системам обработки данных других производителей. С августа 2002 года выпускается вариант ГХ 3900, оснащенный газовым или жидкостным краном-дозатором. Кран монтируется на заводе-изготовителе непосредственно перед инжектором ("upstream"). В качестве жидкостного крана-дозатора используется кран Valco A4CI4WE с объемом 0.2 или 1.0 мкл, газового крана - Valco A4C6WE с петлей 250 мкл. Уникальное конструктивное решение позволяет использовать автосэмплеры 8400 и 8410 в сочетании с установленными кранами. легальными конфигурациями являются: LSV/GSV -> 1177/ПИД, LSV/GSV -> 1041/ПИД, LSV/GSV -> 1041/ДТП. Возможная установка инжектора 1177 с покрытием SilcoSteel. Для оптимизации ввода газовых проб возможна установка газового крана-дозатор после инжектора ("downstream"). Установленные краны также снабжены системой электронного контроля потоков.
Отличительной особенностью прибора является полноразмерный термостат, позволяющий устанавливать колонки на держателях как 5-ти так и 7-ми дюймового диаметра (индустриальный стандарт). Для удобства пользователя, крышка хроматографа снабжена транспортными роликами и может сдвигаться вместе с установленным на нее автосэмплером 8400 или 8410 для проведения работ по рутинному обслуживанию инжектора. Размонтирование и дополнительная юстировка автосэмплера не требуется.